Нашёл интересную заметку про достаточно насущный вопрос. По крайней мере, я с таким сталкивался: "Почему течёт вонючая вода из фильтра?". 

Источник: http://meltice.com.ua/articles/wasser/2009/04/pochemu-techyot-vonyuchaya-voda-iz-filtra/

"Вероятно, вы сталкивались с такой проблемой: когда вы открываете кран фильтра, набираете воду в чашку или кастрюлю - и обнаруживаете, что вода несколько пахнет. В каком-то случае едва-едва, в какам-то случае - сильнее.

Если вы с таким не сталкивались, то, возможно, столкнётесь.

В целом, если в природе что-то имеет странный и неприятный запах, то чаще всего в этом виноваты бактерии. Реже - остальные живые организмы. Дело в том, что в процессе обмена веществ из любого организма выводятся отработанные и вредные вещества. ВОТ ОНИ ТО И ПАХНУТ!

Таки не зря они выводятся.

Соответственно, если из фильтра очистки вытекает вонючая вода, то в этом нет ничего необычного. Просто на самом фильтре поселились бактерии и теперь загрязняют очищенную воду продуктами своей жизнедеятельности. А называется это - вторичное загрязнение воды.

Почему это происходит? Потому что фильтр - это лакомая среда для бактерий - там задерживаются питательные вещества, которые бактерии кушают. Именно по этому стараются фильтры сделать опасными для бактерий, например, насыщают материал фильтра серебром.

Но фильтры с серебром не очень хорошо работают против бактерий. То есть, лучше, конечно, чем обычные фильтры, но со временем трупы бактерий покрывают опасные участки фильтра толстым слоем, и новые бактерии могут с удовольствием начинать там развиваться.

Что делать для того, чтобы этого не происходило? Всё очень просто - чаще менять фильтр. Ведь не зря на фильтрах пишут "максимум полгода”! А именно поэтому. По прошествии 6 месяцев, даже если ресурс фильтра для воды ещё не исчерпан, на фильтре в критическом количестве начинают развиваться бактерии.

На самом деле не обязательно ждать этого критического количества. Менять фильтр следует раньше, чем указанный предельный срок. Это немного дороже, но безопаснее в микробиологическом и токсическом плане."

От себя добавлю ещё одну причину, которая касается в большей степени не прямоточных фильтров обратного осмоса. Так, пользователи фильтров обратного осмоса с накопительными баками также могут столкнуться с таким явлением, как запах или странный привкус очищенной воды.

Это происходит вследствие вторичного загрязнения воды - случайно попавших в уже очищенную воду бактерий. С этими бактериями и продуктами их жизнедеятельности призвана бороться последняя ступень очистки в системах обратного осмоса. Однако, когда бактерий слишком много, эта ступень не справляется.

Выход, похоже, один - замена накопительного бака. Можно попробовать дезинфицировать старый, но - это занятие на любителя. Если система обратного осмоса качественная, или, что лучше, прямоточная - проблемы со вторичным загрязнением воды минимальны или отсутствуют.